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　　 时间到了2046年,生命的奥秘也将被一一解开。尼奥和雅丽是一对恩爱的夫妻，同时也是两位杰出的人类科学家，然而好景不长，一次离奇的意外事件竟夺走了雅丽的生命，对此，尼奥久久不能释怀。
　　 就在尼奥深陷妻子离世而痛苦万分不能自拔的时候，他的导师找到了他并鼓励他振作起来，同时也有一项重要的任务要他参与其中，在导师再三的恳求下，尼奥犹豫再三还是同意了，那是一项新奇而又神秘的科研项目，也是一件长久以来都饱受争议的研究——灵魂的真实性，这是一个困扰了人类几千年的问题。自从妻子雅丽不幸去世后，冥冥中尼奥总能感到妻子就在他的身边并未走远，对妻子的眷恋，又或许是别的什么原因，尼奥对这项研究产生了极大的兴趣。
　　 历史总是惊人的相似，在漫长的探索中，人们总能发现一些令人匪夷所思的事情。随着研究的深入，尼奥的梦境中雅丽出现的频率也越发的频繁起来，一些事情也越发的诡异离奇，这更让尼奥匪夷所思，随着研究的深入，尼奥也逐渐怀疑，甚至相信人类是有灵魂的，而灵魂就在他们的身边，在另一个纬度和空间里，只是缺乏一条通往两个世界的桥梁。
　　 然而，不久后小组的研究便陷入了瓶颈期，像许多的研究一样，只有突破瓶颈才能迎来希望，这也是一直以来探究人类灵魂屡造失败的原因。
　　 就在大家一筹莫展，毫无头绪的时候，一个神秘的牧师突然走进了他们的小组，并提供了一本古老的典籍，那是一本失传已久的亡灵通之书，书中记载着许多神奇的秘法，和许许多多未知的难解的谜题，其中一段就清楚的记录着召唤人类灵魂的古老方法。
　　
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　　 随着研究的再一次深入，一场神秘而诡谲的招魂仪式，经过再三论证与推演，小组的人一致决定要大胆的尝试一下，不然所有的研究都将戛然而止，停滞不前，就在一个血月之夜，一场召唤灵魂的仪式终于开始了。
　　 对未知事物的探索总是艰难的，然而并不像所有研究人员预期的那样，仪式紧张而神秘的开始后，却又在风平浪静中悄然结束，一切平静的似乎让人窒息，本以为这次仪式会有所收获，可依旧毫无结果，这让所有人及其研究再次陷入僵局。
　　 然而没过多久，那次神秘的仪式所产生的连锁反应才慢慢的开始显现出来，在那不久离奇的事情便接踵而至，一次研讨会上牧师突感不适，随后便在他们几个人面前以极其惨烈的方式惨死，面对他那一点点扭曲变形且碎裂的身体，一股神秘的力量让在场的人感到了极度的恐慌，这无疑是对人类一次严厉的警告，甚至是恐吓，然而这并不是最让人害怕的，接下来所有参与招魂仪式的工作人员，都接二连三的出现意外，每个人的死状都恐怖异常，让人心生恐惧。
　　 那天，尼奥六神无主的走在街上，不知怎么忽然就停了下来，他呆呆的站在中间，自己像被施了魔法，此时一辆货车迎面而至，就在这千钧一发之际，耳边忽然传来熟悉的声音，那是雅丽的声音，突然尼奥从麻木中惊醒过来，就在此时雅丽那模糊的幻影将尼奥推离了危险，之后雅丽那鬼魅般的身影也在撞击中消失不见了。
　　 自从那次经历后，尼奥又一次陷入了迷茫，沉思许久尼奥坚定了自己的想法，对人类灵魂的研究变得更加的疯狂，伴随着探究的深入，越来越多的线索和谜题显露出来，那日疲惫的尼奥昏昏睡去，不一会便进入梦中，此时，他仿佛看见妻子缓缓的推开一扇门，一扇他从未发觉的门，门后面是一间密室，密室中有一张桌子，桌子上面零零散散的放着一些书籍，尼奥顺手拿了起来。
　　 惊醒后，发现自己已经身处密室当中，而手上也莫名其妙的多了一些文件，定睛一看那上面都是妻子的研究文献，手稿上记录者对死亡和灵魂的研究，甚至他和那个神秘的牧师早就相识，其实这次神秘的招魂仪式也并不是第一次举行，而先前参与研究的人员包括妻子也都接二连三的惨死，她们像是在上一次仪式中发现了什么，从而遭遇到某种神秘力量的威胁，看来妻子的死并不单单是一场意外，而是为了阻止招魂仪式从而招致的杀身之祸，这更加坚定了尼奥的猜想。
　　
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　　 然而，越来越多的危机随之而来，似乎冥冥中有一股神秘诡谲的力量正在试图阻止尼奥的研究，而每次有危险的时候他总能得到妻子的警示和保护，“下一个是你，就是你，小心、一定要小心！”尼奥相信自己就是下一个被追杀的目标，并对此深信不疑。
　　 为了拯救自己，尼奥查找了记录仪式的摄影记录，在十次的甄别过后，尼奥终于查到了一些蛛丝马迹，就在那仪式开始不久一个模糊的鬼影突然出现在仪式上空，尼奥相信那团恐怖的黑影，一定是研究时打破了某种平衡才出现的神秘物体，紧接着尼奥又从烧毁的古老的典集中发现了至关重要的一环，只有联通生死，才能真正开启捕捉灵魂的仪式，尼奥几经思索终于领悟到了其中的秘密。
　　 不久后，一场仪式又紧锣密鼓的重新开始了，在一段咒语的加持下，几位已经死去的科学家包括他的妻子雅丽又重新被聚集起来，他们重新开启了仪式，终于在一段剧烈的晃动和空气爆裂中生成的一道神秘的蓝光，而蓝光过后，一个浑身腐烂、披着血红斗篷的骷髅人整清晰的漂浮在尼奥面前，“终于、终于还是被你们发现了啊——”那正是死神的化身，它被困在法阵里，突然，它暴怒了奋力的挣扎着，最终它挣脱了束缚，突然又一阵剧烈的爆裂过后，一股强大的能量炸毁了实验室，强大的冲击波也瞬间将尼奥掀翻在地，死神打破了法阵，此时那个血肉模糊的死神用满是枯骨的手死死的揪住奄奄一息的、尼奥的喉咙，警告他“平衡、破坏、死亡、痛苦、悔恨！啊......”说完死神愤怒的对着尼奥张开血盆大口深吐一口气，随后便捉着雅丽的灵魂消失不见了。
　　 之后尼奥的眼睛似乎受到了重创受到了诅咒，当尼奥从医院中苏醒过来时，一个世界渐渐变得模糊，而另一个世界却越发的清晰，尼奥破坏了规则打破了空间的界限，那些死去的人的鬼魂以及另一个世界里所有的秘密，都展现在尼奥的视线里，唯独不见了雅丽的身影。
　　 只因他发现了人类灵魂的秘密，被诅咒被折磨，尼奥证实了人类灵魂的存在和另一个世界的存在等等一系列人们难解的问题，但是没有人会相信他，就在尼奥在两个世界里苦苦挣扎的时候，一个名叫"亚当"的邪恶而神秘的组织，找到了并将他绑架。
　　 那些神秘人把他带到了一个秘密的实验室，那是一个以颠覆全人类为目的的神秘而邪恶的组织，那里关押了许多许多的未知的生物以及很多人类的灵魂，甚至死神也被囚禁其中。
　　 其实，人类早已发现了灵魂的存在，也不止一个组织在深入的研究，只是为了保护人类没有哪个组织愿意把这件事公诸于众，那样会造成全人类的恐慌，但是"亚当”这一邪恶组织恰恰相反，他们的目的就是要颠覆全人类。尼奥一直被关押在密室里，期间“亚当”组织的成员以各种手段逼迫尼奥说出更多关于人类灵魂研究的成果，继而研究出足以改变人类命运的致命武器，就连那些被囚禁的人类的灵魂以及死神也难逃被折磨蹂躏的命运。
　　 然而尼奥不允许他们破坏规则，另一个世界也不允许，一旦破坏平衡那后果将是毁灭性的，尼奥受尽折磨却未透露任何信息，以“亚当”目前所掌握的还不足以颠覆人类的世界，就在尼奥绝望之际，消失已久的雅丽突然出现了。这些日子丽雅一直在躲避追捕，“亚当”一直想用雅丽的灵魂逼迫尼奥，幸好她一直躲藏着，有了妻子的帮助和指引，尼奥顺利的逃离了实验室，并将那里的被囚禁的人类的灵魂通通释放了出去，此刻逃出囚笼的死神也郑重的向他鞠躬致谢，随后一场针对“亚当”这一邪恶组织的成员展开了血腥的报复。
　　 逃离魔窟后尼奥一直四处躲藏，那些“亚当”的残余势力始终在追捕他，为了尼奥为了两个世界的平衡，许多鬼魂聚集在他的身边保护他，妻子也时时陪伴在尼奥的左右，然而那种无法改变的距离，让两个世界的人感到前所未有的孤独，他们明知就在身边无法彼此接近，简直就是一种折磨。
　　 就在此时，丧心病狂的“亚当”组织向全世界公布了他们的发现想以此来颠覆全人类，为了阻止悲剧的发生人类尽量掩盖事实，编造出某个电影的一部分，或者是某个人的恶作剧，可随着时间推移，所谓的秘密也不再是秘密，越来越多的人还是选择相信了一个事实，人类是有灵魂的，还有另一个世界的存在。
　　
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　　 从那一刻起，人类便开启了另一种疯狂的模式——死亡和解脱。对于那些失意又失败的人们来说，这无疑是另一条通往自由的道路，他们都幻想着能够重新赢得幸福的机会，可当那些自愿放弃一切去往另一个世界的人，可曾想过另一个世界也同样充满了悲哀与不幸。
　　 长久以来困扰人类的问题终于在某一天大白于天下，然而活着的人不知为什么活着，而死去的也不知为什么死，人类瞬息间便减少了一半，而那些剩下的残存在人类世界中充满了恐惧哀伤，而另一个世界也开始乱作一团，他们也开起了另一种疯狂的模式——死亡和解脱，摆脱恐惧和痛苦的折磨，世间不再有轮回，有的只是死亡。
　　 在探究生命奥秘的同时，谁都不曾想造成这样的结局，看着一片狼藉毫无生气的世界，尼奥也变得心灰意冷，由其他在面对雅丽的时候那种爱而不得，近在眼前却永远不能触及的感觉让人越发的痛苦，最终失望至极的尼奥也选择了解脱，在那一刻尼奥飞了起来，不再有痛苦，此时死神正带着他的妻子安静的等待着他的到来，那一刻她们终于得以再次重逢。
　　
　　
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